Le secteur secondaire contribue pour près de 20% au PIB. La fabrication emploie près de 25% de la main-d'oeuvre. En terme de valeur ajoutée, les leaders sont les fabricants d'alimentation et de boissons, d'électricité, de gaz et d'alimentation en eau, mais aussi de produits chimiques, de produits à base de pétrole raffiné et de produits fabriqués en métaux. Par tradition, la Croatie est aussi solide au niveau de la construction navale, son industrie de la construction et ses produits à base de tabac.